蛋黄与蛋清在营养成分方面有着相当大的差别，蛋黄的营养价值更高。
1、脂类：蛋清和蛋黄的最大差别表现在脂类方面。蛋黄脂类的含量是蛋清的280倍。实际上，整个鸡蛋中98％的脂类都集中在蛋黄里，蛋清中的脂类是极少的。在蛋黄的脂类中，甘油三酯占62％、磷脂33％，胆固醇约占5％。除此之外，还有少量的脑苷脂类。这些成分在蛋清中几乎是没有的。
2、蛋白质：蛋黄和蛋清中的蛋白质含量差异不大。蛋黄中的蛋白质主要是卵黄磷蛋白和卵黄球蛋白两种，这些蛋白质的营养价值相仿，蛋清中大约含有40种蛋白质，如卵清蛋白、伴清蛋白、卵粘蛋白、卵胶粘蛋白、卵球蛋白等。
3、矿物质含量：在矿物质含量方面，蛋清与蛋黄又有较大差别。蛋黄里的矿物质总量是蛋清的 2倍，微量元素如铁、锌、硒等含量更是远远高出蛋清。但蛋清中钠和钾的含量则比蛋黄高很多。
4、维生素：蛋清和蛋黄含量差别更大，鸡蛋中脂溶性维生素，如维生素a、维生素e、维生素d、维生素k等几乎全部集中于蛋黄内，蛋清中基本不含。水溶性维生素中，维生素b1主要在蛋黄中，蛋清基本不含；维生素b2蛋黄与蛋清含量相仿；蛋黄和蛋清中几乎不含维生素c。