一、挑选所在学校或杂志社等单位机构合作的论文查重系统
学校和杂志社通常都会有专门合作的论文查重系统，如果是毕业生需要查重论文，或者是需要在杂志社发表论文，自己查重的时候也使用对应的查重系统即可。如果不清楚与之合作的查重系统是什么，可以联系学校指导老师或者杂志社工作人员进行咨询。使用相同的查重系统的话，就能确保论文查重结果是一致的，不会有很大的波动。
二、挑选数据库比较大而全面的论文查重系统
论文查重系统的核心和灵魂就是所收录的数据库，数据库比较庞大、范围比较全面、更新频率速度快的查重系统，检测出来的结果更加准确，更具有参考价值。每个查重系统的数据库以及查重算法是有差异的，所以选择时最好注意这方面，这也是选择好的查重系统的一个重要依据。
三、挑选安全保密性高的论文查重系统
论文查重系统的安全保密性要引起重视，不选择有泄露自己论文可能性的系统，比如说一些打着免费的旗号的系统，有极大泄露论文的风险。当然面上也有性价比很高的系统，会有赠送免费查重字数的活动，所以查重之前需要对系统做好一定的了解。